Сериал "Что случилось с секретаршей Ким?" рассказывает историю Ли Ён-джунa, казалось бы, идеального человека. Он вице-президент крупной компании, блестящий и невероятно привлекательный, но его высокомерие отталкивает всех вокруг. Единственный человек, кто годами терпел его непростой характер и безупречно вел все дела — это его секретарь Ким Ми-со. Однако однажды она неожиданно подает заявление об уходе, и это решение переворачивает привычный мир Ён-джунa с ног на голову.

Внезапная потеря заставляет самовлюбленного босса осознать, насколько он зависел от Ми-со, причем не только в рабочих вопросах. Он пытается выяснить причину ее ухода и предлагает все что угодно, лишь бы она осталась. Но Ми-со непреклонна — у нее есть свои планы и причины, о которых Ён-джун даже не догадывался. Их отношения из строго деловых постепенно превращаются в сложную игру, где скрываются личные тайны и невысказанные чувства.

За внешней легкостью и комедийными ситуациями скрывается история двух людей, которые годами были рядом, но совершенно не знали друг друга. Ён-джуну предстоит не просто вернуть ценного сотрудника, а разобраться в себе и понять, что на самом деле для него значит эта женщина. А Ми-со должна решить, готова ли она снова довериться человеку, который привык только командовать.